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dc.date.accessioned2018-11-21T10:25:05Z
dc.date.available2018-11-21T10:25:05Z
dc.date.issued2018
dc.identifierdoi:10.17170/kobra-2018112017
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/123456789/11002
dc.descriptionThis dissertation is based on the following peer-reviewed publications, which are referred to in the text by their Roman numerals: (I) Ordynets A, Savchenko A, Akulov A, Yurchenko E, Malysheva V, Kõljalg U, Vlasák J, Larsson K-H, Langer E (2017) Aphyllophoroid fungi in insular woodlands of eastern Ukraine. Biodiversity Data Journal 5: e22426. doi: 10.3897/BDJ.5.e22426 (II) Ordynets A, Larsson K-H, Langer E (2015) Two new Trechispora species from La Réunion Island. Mycological Progress 14: 113. doi: 10.1007/s11557-015-1133-0 (III) Ordynets A, Scherf D, Pansegrau F, Denecke J, Lysenko L, Larsson K, & Langer E (2018) Short-spored Subulicystidium (Trechisporales, Basidiomycota): high morphological diversity and only partly clear species boundaries. MycoKeys 35: 41-99. doi: 10.3897/mycokeys.35.25678 (IV) Ordynets A, Heilmann-Clausen J, Savchenko A, Bässler C, Volobuev S, Akulov O, Karadelev M, Kotiranta H, Saitta A, Langer E, Abrego N (2018) Do plant-based biogeographical regions shape aphyllophoroid fungal communities in Europe? Journal of Biogeography 45: 1182–1195. doi: 10.1111/jbi.13203eng
dc.language.isoengeng
dc.subjectAgaricomyceteseng
dc.subjectbeta diversityeng
dc.subjectbiodiversity informaticseng
dc.subjectbiometryeng
dc.subjectbiogeographyeng
dc.subjectdistributioneng
dc.subjectHydnodontaceaeeng
dc.subjectnestednesseng
dc.subjectnew specieseng
dc.subjectspecies delimitationeng
dc.subjectspecies richnesseng
dc.subjectspecies turnovereng
dc.subjecttaxon occurrenceeng
dc.subjecttaxonomyeng
dc.subjectBeta-Diversitätger
dc.subjectBiodiversitätsinformatikger
dc.subjectBiometrieger
dc.subjectBiogeographieger
dc.subjectVerbreitungger
dc.subjectneue Artenger
dc.subjectArtenabgrenzungger
dc.subjectArtenreichtumger
dc.subjectArtenumsatzger
dc.subjectTaxonvorkommenger
dc.subjectTaxonomieger
dc.subject.ddc000
dc.subject.ddc004
dc.subject.ddc500
dc.subject.ddc570
dc.titleDiversity of aphyllophoroid fungi from taxonomical and biogeographical perspectivesger
dc.typeDissertation
dcterms.abstractComprehensive knowledge of biodiversity is a prerequisite for its long-term conservation and sustainable use. Fungi play crucial roles in ecosystems and are among the species-richest organism groups on Earth. However, all aspects of their diversity remain underexplored. In this study, we aimed to fill the gaps in occurrence data and taxonomy as well as in understanding spatial diversity patterns of aphyllophoroid fungi (non-gilled macroscopic Basidiomycota). We digitized and made openly accessible 4,041 records of aphyllophoroid fungi from Central and Eastern Europe and several tropical areas. Numerous specimen records were associated with newly generated nuclear ribosomal DNA sequences (74 of ITS regions and 59 of 28S region) and numerous observations also with photographs depicting diagnostic features of fungal fruitbodies. We described 13 new species of aphyllophoroid fungi based on morphological examination combined with DNA barcoding and phylogenetic Bayesian and Maximum likelihood analyses using ITS and 28S DNA sequences. Two new species belong to the genus Trechispora P. Karst. and eleven to the genus Subulicystidium Parmasto. In the latter, species-level variation in basidiospore size and shape was re-evaluated based on systematic measurements of 2,840 spores from 67 sequenced specimens. An updated identification key to all known species of Subulicystidium was provided. Using DNA-based evidence, in the studied lineage (Trechisporales K.H.Larss.) we showed for the first time a possibility of a transoceanic distribution. Based on a dataset consisting of 14,030 fruitbody occurrences of 1,491 aphyllophoroid fungal species from 39 European areas, we showed that importance of biogeographical regions in determining European aphyllophoroid fungal communities varies for different diversity components. Species richness and nestedness were best explained by European biogeographical regions, whereas overall beta-diversity and species turnover were driven mostly by variation in climate, and nestedness mostly by tree species occupancy. Beta diversity patterns of aphyllophoroid fungi did not differ between southern and northern Europe. Therefore, at the continental scale, aphyllophoroid fungi are less shaped by historical legacies than vascular plant and animal communities.eng
dcterms.abstractUmfassendes Wissen über die Biodiversität ist eine Voraussetzung für ihre langfristige Erhaltung und nachhaltige Nutzung. Pilze spielen eine wichtige Rolle in Ökosystemen und gehören zu den artenreichsten Organismengruppen auf der Erde. Jedoch sind noch nicht alle Aspekte ihrer Vielfalt vollständig erforscht. In dieser Studie haben wir uns zum Ziel gesetzt, die Lücken in den Verbreitungsdaten und der Taxonomie sowie im Verständnis der räumlichen Diversitätsmuster von aphyllophoroiden Pilzen (makroskopische Nichtblätterpilze der Basidiomycota) zu füllen. Wir haben 4,041 Datensätze von aphyllophoroiden Pilzen aus Mittel- und Osteuropa und verschiedenen tropischen Gebieten digitalisiert und veröffentlicht. Zahlreiche Herbarbelege wurden durch neu erzeugte nukleäre ribosomale DNS-Sequenzen (74 der ITS-Region und 59 der 28S-Region) sowie Fotografien, und diagnostischen Merkmalen zur Artbestimmung von Pilzfruchtkörpern zeigen, ergänzt. Wir haben 13 neue Arten von aphyllophoroiden Pilzen beschrieben basierend auf morphologischen Untersuchungen in Kombination mit DNA-Barcoding und phylogenetischer Bayesian und Maximum-Likelihood-Analysen von ITS und 28S DNA-Sequenzen. Zwei neue Arten gehören zur Gattung Trechispora P. Karst. und elf zur Gattung Subulicystidium Parmasto. Im letzteren Fall wurde die Variation der Größe und Form der Basidiosporen auf Artebene neu bewertet, basierend auf systematischen Messungen von 2,840 Sporen von 67 sequenzierten Proben. Ein aktualisierter Identifizierungsschlüssel für alle bekannten Arten von Subulicystidium wurde bereitgestellt. Mittels DNA-basierter Evidenz zeigten wir in der untersuchten Linie (Trechisporales K.H.Larss.) erstmals die Möglichkeit einer transozeanischen Verbreitung innerhalb von Arten. Basierend auf einem Datensatz, der aus 14,030 Fruchtkörpervorkommen von 1,491 aphyllophoroiden Pilzarten aus 39 europäischen Gebieten besteht, haben wir gezeigt, dass der Einfluss von biogeographischen Regionen bei die Bestimmung europäischer aphyllophoroider Pilzgemeinschaften für verschiedene Diversitätskomponenten variiert. Artenreichtum und Nestedness ließen sich am besten durch europäische biogeografische Regionen erklären, während die gesamte Beta-Diversität und der Artenumsatz hauptsächlich durch Klimaschwankungen verursacht wurde, und die Nestedness hauptsächlich durch die Besiedlung der Baumarten bestimmt wurde. Die Beta-Diversitätsmuster von aphyllophoroiden Pilzen unterschieden sich nicht zwischen Süd- und Nordeuropa. Daher sind aphyllophoroide Pilze auf kontinentaler Ebene weniger durch historische Vermächtnisse geprägt als durch vaskuläre Pflanzen- und Tiergemeinschaften.ger
dcterms.accessRightsopen access
dcterms.creatorOrdynets, Oleksandr
dcterms.dateAccepted2018-10-23
dc.contributor.corporatenameKassel, Universität Kassel, Fachbereich Mathematik und Naturwissenschaften, Institut für Biologie
dc.contributor.refereeLanger, Ewald (Prof. Dr.)
dc.subject.swdInformatikger
dc.subject.swdBiodiversitätger
dc.subject.swdArtenreichtumger
dc.subject.swdBiogeographieger
dc.subject.swdPilzeger
dc.type.versionpublishedVersion


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