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Dissertation
Functional analyses of Dph1•Dph2 in synthesis of diphthamide, a clinically relevant modification on eEF2
(2024)
Diphthamide is a unique post-translational modification of a conserved histidine on the eukaryotic translation elongation factor 2 (eEF2). During translation elongation, eEF2 induces translocation of codon-anticodon duplexes across the ribosomal decoding center. Diphthamide is involved in fine-tuning of this process by stabilizing the codon-anticodon duplex and maintaining reading frame accuracy. Initially, diphthamide was identified as the target for diphtheria toxin, enabling ADP-ribosylation of eEF2 and resulting ...
Dissertation
The tRNA binding protein Kti12 and its role in the regulation of Elongator complex
(2020-06-08)
[Summary] Kti12 is a conserved eukaryotic protein showing sequence homology to O-phosphoseryltRNA kinase (Pstk), which is required for the synthesis of selenocysteine tRNA. Saccharomyces cerevisiae Kti12 was originally discovered in a genetic screening for resistance against zymocin, a protein toxin produced by Kluyveromyces lactis. The cytotoxicity of zymocin lies in its anticodon nuclease activity, causing tRNA depletion and cell death in sensitive yeast cells. It recognizes and cleaves a particular wobble uridine ...
Dissertation
Investigation of the functional synergy and involvement of different tRNA modifications in translational control
(2020-07-02)
Transfer RNAs are essential adapter molecules employed in the translational process and are highly modified all over their structure. Specific modification of the four canonical ribonucleotides (A, U, C, G) is accomplished by various proteins and/or protein complexes, ranging from simple isomerisations (e.g. Ψ) and methylations (e.g. m5C) up to complex chemical structures (e.g. mcm5s2U, ct6A). The functions of tRNA modifications are linked to the specific position and may influence translation by supporting the native ...
Dissertation
Diphthamide modified eEF2: Insights into Function, Crosstalk and Disease
(2020)
Diphthamid ist eine posttranslationale Proteinmodifikation eines konservierten Histidins an dem eukaryotischen und archaealen translations-elongations Faktor 2 (eEF2 und aEF2). Obwohl die Diphthamidbiosynthese ein komplexer und gut beschriebener Ablauf ist, gibt es bisher keine detaillierte Beschreibung einer positiven zellulären Funktion der Modifikation.
Dissertation
The Importance of tRNA Modification and SSD1 Status for Protein Homeostasis and Cell Viability
(2022-03)
Chemical modifications of anticodon loop are required to support tRNA function in mRNA decoding and to prevent protein aggregation in the eukaryotic model system Saccharomyces cerevisiae. This work investigates the effects of mutation in the gene encoding the Deg1 pseudouridine synthase. It is known that the mutation of the human DEG1 orthologue PUS3 causes severe neurological and developmental defects, emphasizing the general importance of the modification. However, the exact cellular consequences of deg1/pus3mutation ...
Dissertation
Charakterisierung der mikrobiellen Population und Untersuchungen zum Quorum Sensing in der Rhizosphäre vom Weidelgras (Lolium perenne) auf einer Rückstandshalde der Kaliindustrie
(2010-07-16)
Im Rahmen dieser Dissertation wurden die Dynamik und die Kommunikation innerhalb der mikrobiellen Population der Rhizosphäre von Deutschem Weidelgras (Lolium perenne) untersucht, welches auf einer teilweise rekultivierten Rückstandshalde der Kaliindustrie wuchs.
Um die niederschlagsbedingte Auswaschung von Salzen zu reduzieren, wird die Rückstandshalde des Kaliwerks Sigmundshall (in Bokeloh bei Hannover) schrittweise mit dem technogenen Abdecksubstrat REKAL/SAV ummantelt. Dieses weist eine hohe Standfestigkeit und ...
Dissertation
Charakterisierung des Ubiquitin-ähnlichen Proteins Urm1 in Saccharomyces cerevisiae
(2016-05-11)
Das ursprünglich in S. cerevisiae identifizierte Urm1 stellt aufgrund seiner dualen Funktionsweise ein besonderes UBL dar. In einem Prozess, der als Urmylierung bezeichnet wird, kann es ähnlich dem Ubiquitin kovalent mit anderen Proteinen verknüpft werden. Zusätzlich fungiert es aber auch als Schwefelträger, der an der Thiolierung des wobble-Uridins bestimmter cytoplasmatischer tRNAs beteiligt ist. Während neuere Untersuchungen zeigen, dass die Urm1-abhängige tRNA-Thiolierung zu einer effizienten Translation in ...
Dissertation
Untersuchungen zur Biofilmbildung bei dem klinischen Isolat Enterococcus faecalis 1.10
(2013-07-05)
In der vorliegenden Arbeit wurde die Biofilmbildung bei einem klinischen Isolat von Enterococcus faecalis untersucht. Der Prozess der Biofilmbildung ist in mehrere Abschnitte unterteilt und beinhaltet zu Beginn eine Anhaftung von Zellen an Oberflächen. Dieser adhäsive Schritt wird unter anderem durch Pili vermittelt. Pili bei Grampositiven Mikroorganismen sind kovalent mit der Zellwand verknüpfte Proteinstrukturen, die eine Anheftung an biotische und abiotische Oberflächen sowie den Zell-Zell-Kontakt vermitteln. Bei ...
Dissertation
Untersuchungen zur Verbreitung von Klasse II-Transposons wie Tn21, Tn501 und Tn3 in terrestrischen Habitaten
(2005-03-14)
Mobile genetische Elementen wie Transposons wurden in unbelasteten Böden nachgewiesen. Hierzu wurden unterschiedliche Ansätze gewählt: Verschiedene, unbelastete Böden wurden mittels PCR auf das Vorhandensein von Markergenen, in diesem Fall Transposasen vom Typ Tn3, Tn21 und Tn501, hin untersucht. Hierzu wurde ein System entwickelt, welches es ermöglichte die Gesamt-DNA aus verschiedensten Böden mit einem System einfach und reproduzierbar zu extrahieren und anschließend mittels PCR zu untersuchen. Die mittlere ...