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Dissertation
Diversity of aphyllophoroid fungi from taxonomical and biogeographical perspectives
(2018)
Comprehensive knowledge of biodiversity is a prerequisite for its long-term conservation and sustainable use. Fungi play crucial roles in ecosystems and are among the species-richest organism groups on Earth. However, all aspects of their diversity remain underexplored.
In this study, we aimed to fill the gaps in occurrence data and taxonomy as well as in understanding spatial diversity patterns of aphyllophoroid fungi (non-gilled macroscopic Basidiomycota). We digitized and made openly accessible 4,041 records of ...
Dissertation
Die Physiologie des Wirts-Parasitsystems pathogener Pilze des Eschentriebsterbens
(2019)
In der vorliegenden Arbeit wurde versucht, die optimalen Wachstumsbedingungen des Pilzes H. fraxineus (Haupterreger des Eschentriebsterbens) zu ermitteln. Dafür wurden drei Wachstumsversuche (Nährmedium, pH-Wert und Temperatur) an 25 Pilzstämmen durchgeführt.
• Die Ergebnisse des Nährmediumwachstumsversuches zeigten, dass Maismehl Agar Medium (MmA) die schnellste Kultivierung des Pilzes förderte und als das optimale Nährmedium gelten kann (im Vergleich mit den anderen sechs geprüften Nährmedien).
• Der pH-Wert-Versuch ...
Dissertation
BamB facilitates folding of outer membrane protein A (OmpA) via interactions of its β-propeller with the membrane surface and via a conformation change induced by phosphatidylglycerol
(2019-10-17)
A sufficient folding and insertion of OMPs into the OM of Gram-negative bacteria requires the conserved β-barrel assembly machinery (BAM) complex. The present thesis concerns the structural properties and folding behavior of the lipoprotein BamB and describes its relevance in the synchronized mechanism of membrane insertion and folding of the β-barrel protein OmpA. Furthermore, specific binding sites in BamB involved in the interaction to the lipid membrane or the periplasmic domain of BamA (PD-BamA) were identified ...
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Mechanistic Insights into the intrinsic Kinase Regulation of LRRK2
(2019-06)
Obwohl Morbus Parkinson (PD) die zweithäufigste neurodegenerative Erkrankung darstellt, ist der Pathomechanismus kaum verstanden. Es ist jedoch erwiesen, dass PD assoziierte Mutationen die Aktivität der Leucine rich repeat kinase 2 (LRRK2) beeinflussen, sodass diese ein potentielles Drug Target darstellt. Für ein besseres Verständnis wurden daher der intrinsische regulatorische Mechanismus und der Einfluss von Mutationen auf LRRK2 untersucht. Zusätzlich wurde der Einfluss von Nanobodies gegen die ROC Domäne von LRRK2 ...
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Untersuchungen zur Dynamik des Lipid-Metabolismus von Dictyostelium discoideum
(2014-06-05)
Die soziale Waldamöbe Dictystelium discoideum ist ein etablierter Modellorganismus zur Erforschung grundlegender zellbiologischer Prozesse. Innerhalb der letzten Jahre konnte dabei insbesondere das Wissen zum Lipidmetabolismus umfassend erweitert werden. In diesem Zusammenhang spielt besonders eine Enzymgruppe eine wichtige Rolle: die LC/VLC-Acyl-CoA-Synthetasen. Diese übernehmen dabei die Aufgabe Fettsäuren zu aktivieren, um sie so dem Zellmetabolismus überhaupt erst zugänglich zu machen. D. discoideum verfügt über ...
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Lokalisation und Funktion von Mitgliedern der Familie der short-chain Dehydrogenasen/Reduktasen in Dictyostelium discoideum
(2015-11-25)
Dictyostelium discoideum wird als Modellorganismus für diverse Krankheitsbilder benutzt. Darunter zählen lysosomale, neurodegenerative Störungen sowie Stoffwechselerkrankungen. Werden diese Amöben mit einer Fettsäure gefüttert, so wird die Biogenese von lipid droplets (LDs) initiiert. Diese dynamischen Organellen dienen der Neutrallipidspeicherung. Das Proteom der LDs konnte für D. discoideum entschlüsselt werden. Unter den rund 70 Proteinen, befinden sich ca. 15, die eine Funktion im Lipidstoffwechsel haben. Darunter ...
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Lipid Droplets und assoziierte Proteine im Wachstum und der multizellulären Entwicklung von Dictyostelium discoideum
(2017-12-15)
Zusammenfassung:
Lipid Droplets (LDs) und damit assoziierte Proteine wurden bisher in D. discoideum ausschließlich in dem einzelligen, vegetativen Stadium untersucht. Die Ergebnisse der vorliegenden Arbeit zeigen deren Einfluss auf die multizelluläre Entwicklung. Statt in der Hungerphase einen Vorteil durch gespeicherte Fettreserven zu vermitteln, stirbt ein Großteil der fetten Zellen in der Entwicklung. Im Mischexperiment, in dem unbehandelten Zellen mit LD-tragenden Zellen kompetieren, stellen letztere nur 10 % ...
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Lipid Droplets in Dictyostelium discoideum
(2010-12-15)
Lipid Droplets dienen zur Speicherung von Neutrallipiden wie z. B. Triglyceriden und Sterolestern. Im ersten Teil der vorliegenden Arbeit wurde die Bildung dieser zellulären Fettspeicher in D. discoideum untersucht. Es konnte herausgefunden werden, dass Lipid Droplets entstehen, wenn die Zellen entweder in einer Suspension von Bakterien oder in Gegenwart von Palmitinsäure kultiviert werden. Die Bildung der Lipidtröpfchen wird dabei von einem schnelleren Zellwachstum, einem Anstieg des Triglyceridgehalts, einer Reduktion ...
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Charakterisierung potentiell positiver Regulatoren der Phagozytose in Dictyostelium discoideum und deren Funktion in einem Signalweg zwischen endosomaler Verdauung und Partikelaufnahme
(2011-10-24)
Dictyostelium discoideum ernährt sich in seinem natürlichen Habitat, dem Waldboden, vorwiegend von Bakterien. Diese werden aus der Umgebung über Phagozytose aufgenommen und unter anderem mit Hilfe von Lysozymen verdaut. Eines dieser Lysozyme, AlyA, wurde bereits in vorhergehenden Arbeiten detailliert untersucht. Sein Fehlen resultierte in einer zeitabhängigen Vergrößerung der Fresshöfe in Bakterienrasen. Zusätzlich waren in diesen Knockout-Mutanten auch die Phagozytoserate und die Expression eines zweiten lysosomalen ...
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Biologische Funktionsanalyse und Identifizierung neuer Substrate der Methyltransferase Dnmt2
(2012-01-25)
Obwohl die DNA Methyltransferase 2 (Dnmt2) hoch konserviert ist und zu der am weitesten verbreiteten eukaryotischen MTase-Familie gehört, ist ihre biologische Funktion nach wie vor unklar. Nachdem lange Zeit keine DNA Methylierungsaktivität nachgewiesen werden konnte, wurde vor einigen Jahren über geringe Mengen an 5-Methylcytosin (5mC) in Retroelementen der “Dnmt2-only”-Organismen D. melanogaster, D. discoideum und E. histolytica berichtet (Kunert et al. 2003; Fisher et al. 2004; Kuhlmann et al. 2005; Phalke et al. ...