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Dissertation
Molekulare Systematik der Gattung Suaeda (Chenopodiaceae) und Evolution des C4-Photosynthesesyndroms
(2011-12-19)
Mit der vorliegenden Arbeit wird eine Synthese aus molekularer Phylogenie und Merkmalsentwicklung für die Unterfamilie Suaedoideae der Chenopodiaceae präsentiert. Anhand von rekonstruierten Stammbäumen aus den Sequenzunterschieden von DNA-Abschnitten zweier unabhängiger Genome (Kern, Chloroplast) werden monophyletische Gruppen herausgearbeitet und die Variabilität der molekularen Merkmale in Bezug auf die bekannten Arten diskutiert. Insgesamt wurden für alle molekularen Analysen 294 Sequenzen ausgewertet. Mit 254 ...
Dissertation
Untersuchungen zur Rolle von Isoformen katalytischer Untereinheiten der PKA
(2012-03-28)
ZUSAMMENFASSUNG: Proteinkinasen übernehmen zentrale Aufgaben in der Signaltransduktion höherer Zellen. Dabei ist die cAMP-abhängige Proteinkinase (PKA) bezüglich ihrer Struktur und Funktion eine der am besten charakterisierten Proteinkinasen. Trotzdem ist wenig über direkte Interaktionspartner der katalytischen Untereinheiten (PKA-C) bekannt.
In einem Split-Ubiquitin basiertem Yeast Two Hybrid- (Y2H-)System wurden potenzielle Interaktionspartner der PKA-C identifiziert. Als Bait wurden sowohl die humane Hauptisoform ...
Dissertation
Neurochondrin und Rack1 vermitteln die Signalintegration der Proteinkinase A
(2015-02-02)
Die Spezifität und Effizienz zellulärer Signalprozesse wird durch die intrazelluläre Kompartimentierung von Signalmolekülen erreicht. A-Kinase-Ankerproteine (AKAPs) bilden eine Familie aus Gerüstproteinen, die zeitliche und räumliche Lokalisation der cAMP-abhängigen Proteinkinase (PKA) übernehmen. Die direkte Interaktion wird dabei über die Dimerisierungs- und Dockingdomäne (DD-Domäne) der regulatorischen Untereinheiten von PKA vermittelt. Das charakteristische strukturelle Merkmal bei kanonischen AKAPs ist eine ...
Dissertation
Structural insights into the allosteric activation mechanism of cGMP-dependent protein kinase I
(2016-05-09)
Cyclic GMP-dependent protein kinase (PKG) is a key transducer in the NO-cGMP signaling pathway. In this line, PKG has been considered an important drug target for treating hypertensive cardiovascular and pulmonary diseases. However, the investigation of PKG’s allosteric activation mechanism has been hampered by a lack of structural information. One of the fundamental questions on the cGMP-dependent activation of PKG is how the enzyme can distinguish cGMP over cAMP and selectively respond to cGMP. To ensure proper ...
Dissertation
Neue Wege zur Proteinsynthese IRES-vermittelte Translation und die Bedeutung von dicistronischen mRNAs bei Drosophila
(2012-12-12)
In dieser Arbeit ist die zentrale Frage, warum dicistronische mRNAs, eine für Eukaryoten untypische Organisation, existieren und wie die Translation des zweiten offenen Leserasters initiiert wird. In sieben von neun anfänglich ausgewählten Genkassetten werden tatsächlich nur dicistronische und keine monocistronischen Transkripte gebildet. Im Laufe der Evolution scheint diese Organisation nicht immer erhalten zu bleiben - es finden sich Hinweise für einen operonartigen Aufbau.
Nach Transformation mit einem dicistronischen ...
Dissertation
BamB facilitates folding of outer membrane protein A (OmpA) via interactions of its β-propeller with the membrane surface and via a conformation change induced by phosphatidylglycerol
(2019-10-17)
A sufficient folding and insertion of OMPs into the OM of Gram-negative bacteria requires the conserved β-barrel assembly machinery (BAM) complex. The present thesis concerns the structural properties and folding behavior of the lipoprotein BamB and describes its relevance in the synchronized mechanism of membrane insertion and folding of the β-barrel protein OmpA. Furthermore, specific binding sites in BamB involved in the interaction to the lipid membrane or the periplasmic domain of BamA (PD-BamA) were identified ...
Aufsatz
Fat-containing cells are eliminated during Dictyostelium development
(2017-09-15)
Triacylglycerol is a universal storage molecule for metabolic energy in living organisms. However, Dictyostelium amoebae, that have accumulated storage fat from added fatty acids do not progress through the starvation period preceding the development of the durable spore. Mutants deficient in genes of fat metabolism, such as fcsA, encoding a fatty acid activating enzyme, or dgat1 and dgat2, specifying proteins that synthesize triacylglycerol, strongly increase their chances to contribute to the spore fraction of the ...
Aufsatz
Aphyllophoroid fungi in insular woodlands of eastern Ukraine
(2017-12-22)
Background
Fungi play crucial roles in ecosystems and are among the species-richest organism groups on Earth. However, knowledge on their occurrence lags behind the data for animals and plants. Recent analyses of fungal occurrence data from Western, Central and Northern Europe provided important insights into response of fungi to global warming. The consequences of the global changes for biodiversity on a larger geographical scale are not yet understood. Landscapes of Eastern Europe and particularly of eastern ...
Dissertation
Genregulation in der Drosophila Spermatogenese am Beispiel der Mst(3)CGP-Genfamilie
(2016-06-21)
In dieser Dissertation wird die Rolle des zentralen Kontrollelementes TCE auf unterschiedlichen Ebenen der Genexpression untersucht. Das TCE verhindert die Translation prämeiotisch gebildeter mRNAs in der Spermatogenese von Drosophila bis zu einem späten postmeiotischen Stadium. Gleichzeitig provoziert es Transkriptionsaktivität. Das TCE wurde zunächst in einer kleinen Genfamilie identifiziert und am Beispiel des Gens Mst87F detaillierter untersucht. In EMSA-Experimenten wurde die Komplexbildung mit regulatorischen ...